[年末調整]-[年末調整入力] で再計算の作業が必要です。
○社員ごとに再計算する場合
[年末調整入力] で該当社員を呼び出し、 F12[登録] を行ってください。
○複数社員を一括で再計算する場合
[年末調整入力] を開き、 F3[一括計算] を行ってください。
※社員を選択していないときに、F3[一括計算]が表示されます。

[社員登録] -「個人情報2]タブの年末調整区分が「12月給与」または「最終賞与」で、 既に F11[転送] まで
行っている場合は、 [年末調整入力] で再度 F11[転送] を行ってください。

〈参考〉
該当社員が転送済かどうかを確認する方法
[年末調整入力]-F5[登録状況] から確認することができます。
該当社員の「状況」欄が「転送済」の場合、 F11[転送] を行っています。
