【A1】
[元帳] を開き期間を、 [期首] ~ [決算] 、科目を9999:諸口に変更して集計してください。
残高が残っている場合、貸借が一致しない原因となります。
原因となる伝票を確認し修正を行ってください。

【A2】
[試算表] の繰越列の貸借は一致していますか?
一致していない場合、前年度から繰越してきた期首残高に誤りがあります。
[初期設定] - [期首残高入力] の修正を行ってください。
※注意※
修正後は元の状態に戻すことはできません。修正前に必ずデータバックアップを行ってください。